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總統府爆發共諜案，台北地檢署(2009/1/14)破天荒搜索總統府，調查發現，總統府專員王仁炳涉嫌將馬、蕭籌備就職等相關機密文件洩漏給立委廖國棟前助理陳品仁後，轉交中國，2人在偵訊後被依違反國家安全法洩密罪，(2009/1/15)凌晨裁定收押禁見。

總統府專委王仁炳涉嫌在2008年3、4月政權交接之際，將馬、蕭宣誓就職、籌備事宜等相關文件，影印交付立委助理陳品仁，陳品仁再傳真給中國情報部門，犯罪時間從扁政府執政開始至少長達2年，洩露的機密超過上百件。由於王仁炳被認為親綠，事發第一時間，外界甚至猜測，這是總統府在清查前朝政府的暗樁，總統府澄清調查王仁炳沒有政治考量。涉嫌違反國家安全法，雖然無關國防機密，但已經引發府方高層震怒，二十四小時內兩度召開記者會，強調要加強管控。全國最高權力核心總統府竟然有文官擔任共諜，府方全面清查，有無更機密文件遭對岸掌握，危機處理。

王仁炳具公務人員身分，若查出洩密、收取不正利益間的相關對價，被告可能還將面臨刑責更重的貪污治罪條例追訴。檢方發現王仁炳曾任國會聯絡人，疑因這層關係認識曾擔任過立委助理的陳品仁，而陳品仁則自民國96、97年間，以在兩岸開設生技公司、並擔任總經理一職為幌子，利用收受公司帳戶相關款項之便，將總統府內部分機密文件交給中國大陸。檢方經由鎖定電話號碼，攔截到被告的異常傳真，查出陳品仁都是經由另一名未到案男子，將文件傳真到中國大陸華北地區，雖然昨天檢調搜索行動查扣近百件相關文件，但是否都屬於洩密內容，還需過濾。辦案人員表示，王仁炳認為總統府是「最危險的地方即最安全的地方」，相信沒人敢搜索總統府，因此都大膽將相關文件放在自己的櫃子與抽屜，昨天搜索時才得以保存證據，而對岸疑出錢替被告「包二奶」，吸收被告蒐集情資，但相關細節與不正利益仍待調查。檢調查出王仁炳疑洩密內容，包括去年520正副總統宣誓就職籌備資料、正副總統文物移交清冊、政權交接小組名單、總統府內組織配置圖、電話分機表等，洩漏內容均屬國防以外秘密，已觸犯國家安全法與國家機密保護法。